行有限度的否定了。
只不过谁也没有象王夫之这样，对朱程理学如此旗帜鲜明的批判、否定过。
因此他的学说一经提出，立即引发了强烈的震动，每天找他辩论的人多不胜数。
黄宗羲的大名不下于王夫之，他也反对朱程理学中“理在气先”的理论，认为“理”并不是客观存在的物质实体，而是“气”的运动规律，认为“气质人心是浑然流行之体，公共之物也”。这与王夫之的理论大同小异。
黄宗羲推崇王阳明“格物致知，知行合一”的思想，对秦牧在岳麓书院开办“物理”课非常赞赏，认为这种寻求万物运行的内在道理的学说，与心学中的格物致知是一样的。
而他引起轰动的原因并不是因为他提出了与王夫之基本相同的观点，他比王夫之更牛，不但挑战了朱程理学，还对皇权提出了挑战。
他说设立君主的本来目的是为了“使天下受其利”、“使天下释其害”，也就是说，产生君主，是要君主负担起抑私利、兴公利的责任。
对于君主，他的义务是首要的，权力是从属于义务之后为履行其义务服务的。君主只是天下的公仆而已。
他提出“古者以天下为主，君为客，凡君之毕世而经营者，为天下也”。这甚基本上是对君主“家天下”的行为从根本上否定了其合法性。
这一点，就连秦牧也没想到，在他掀起的这股思想大潮下，竟然有人敢站出来否定“家天下”合法性了。
黄宗羲与王夫之两人的思想与顾炎武、傅青主的引导遥相呼应，引起了极大的反响。
那些支持朱程理学的人纷纷跳出来撰文驳斥，这股思想碰撞的激烈程度，真不亚于江北的大战。
朝中的杨廷麟等人顾不得学者们的辩论了，秦牧突然改变计划，竟然下旨让苏谨退到来安县，使得滁州只剩下八千人马。
正所谓君子不立危墙之下。秦牧是一国之主，困于滁州，兵微将寡，这还得了？
诸葛敏、杨廷麟、堵胤锡、卞狄、刘伯全、白铁、宋应星、覃秋白等一大批文官一齐杀到兵部，要何亮立即调兵北上救援滁州。
兵部尚书何亮，侍郎顾君恩等一时成了众矢之的。
何亮没奈何，拿出秦牧发回的旨意给大家看，委曲地说道：“各位的心情我理解，但是秦王有旨，本官可不敢抗旨不遵。”
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